Theo Quyết định số 57/QĐ-VKTTVMTB , ngày 30 tháng 01 năm 2026 của Viện trưởng Viện Khoa học Khí tượng Thủy văn, Môi trường và Biển quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Văn phòng như sau:
- Văn phòng có Chánh Văn phòng và các Phó Chánh Văn phòng (số lượng cấp Phó sẽ được điều chỉnh đúng quy định theo lộ trình), viên chức và người lao động.
- Chánh Văn phòng chịu trách nhiệm trước pháp luật và trước Viện trưởng về toàn bộ hoạt động của Văn phòng; ký các văn bản theo ủy quyền hoặc thừa lệnh của Viện trưởng; xây dựng quy chế làm việc và điều hành các hoạt động của Văn phòng.
- Các Phó Chánh Văn phòng giúp việc Chánh Văn phòng, chịu trách nhiệm trước Chánh Văn phòng, trước Viện trưởng và trước pháp luật về nhiệm vụ được phân công.
- Viên chức và người lao động trong Văn phòng thực hiện các nhiệm vụ theo vị trí việc làm và phân công của lãnh đạo Văn phòng, chịu trách nhiệm trước Chánh Văn phòng và trước pháp luật về việc thực hiện các nhiệm vụ được giao.